今夏、東京で開催される麻雀の世界大会W R C。過去すべての大会で優勝してきたのが日本だ。ニンジャという絶対王者を擁する日本は今大会でも優勝が確実視されていた。一方、不慮の事故により怪我を負って野球を断念し、鬱々と最後の高校生活を送っていた坂本蓮はなんとなく始めたネット麻雀で不敗のニンジャの異名を取るほどだったが、どこか熱くなれずにいた。世界で戦うニンジャとネットで無敗のニンジャ。ふたりのニンジャが出会った時、何かが…！？

日本発祥のリーチ麻雀は世界中に広がり、今や頭脳スポーツとして世界大会が行われるほど。世はまさに麻雀戦国時代の様相を呈していた。主人公・坂本蓮は野球特待生として高校に入学したが大怪我により夢を断念せざるを得なくなる。失意の蓮はふと始めたネット麻雀に自身の存在価値を見出し、そこでは「無敗のニンジャ」と称されるようになる。そんな日々を過ごしていた蓮がひょんなことから生身の人間を相手にした初めての麻雀をすることに…。

怪我により野球を断念せざるを得なくなり自分の居場所を失った坂本蓮だったが、ネット麻雀に出会い「不敗のニンジャ」として名を馳せるまでに才能を開花させていた。そんな蓮がひょんなことから老人ホームで初めて生身の人間と対人麻雀をするハメになる。最初のうちは年寄り相手とタカをくくっていた蓮だったが、セオリー無視の自由すぎる老人たちの昭和スタイル麻雀に翻弄され、パニックに陥っていた…。

老人二人と巨乳介護士との麻雀で坂本蓮は劣勢に立たされていた。ネット麻雀で無敗を誇る蓮の戦略はことごとく裏をかかれ、大惨敗。打ちひしがれた蓮はあてもなく彷徨い、いつしか学園のマドンナ・さやかの豪邸前に…。するとマスクを被った麻雀世界１位の「ニンジャ」がその豪邸から出てきた。後をつける蓮だったが、ニンジャは目の前で倒れ、マスクを蓮に渡すと消えてしまう。突然マスクを託された蓮は！？

初めての対人麻雀。初めての敗北。そして蓮にマスクを託し忽然と姿を消した麻雀世界王者のニンジャ…さまざまな出来事が一度に起こり混乱する蓮。敗北の悔しさが沸々と湧き上がり自分の実力を試すため、単身、渋谷の雀荘へと向かうと、そこでは麻雀世界大会に出場予定の海外選手たちが熱闘を繰り広げていた。その中の一人、イーピンマスクがなぜか蓮にニンジャの気配を感じ詰め寄ってきて…！！

麻雀の現世界王者にして正体不明のマスクマン・ニンジャと勘違いされた蓮。ニンジャにリベンジを誓う各国代表の猛者から対戦を迫られる。ギャラリーも熱狂し、渋谷の雀荘は大騒ぎとなったが、そこに居合わせたポン子の助けでその騒ぎからは脱出！しかし彼女に麻雀対戦を持ちかけられることに…。承諾した蓮を待っていたのはMリーグのトッププロ黒島と佐々木だった。コテンパンにやられた蓮は！？

渋谷の雀荘で出会ったポン子の仲介でMリーグのトッププロと対戦した蓮だったが、力の差を見せつけられ完敗してしまう。老人たちとの対戦を皮切りに、対人麻雀で負けっぱなしの蓮。ネット麻雀では無敗という自信とプライドは粉々に打ち砕かれてしまう。何ひとつ上手くいかない人生で麻雀だけが自分自身の存在意義だと痛感した蓮は「強くなりたい」と初めて人前で本心を吐露する…。

「強くなりたい」…自分を誤魔化してきた蓮がついに本音を爆発させた。そんな蓮の思いに手を差し伸べる老人たち。かつて一時代を築いたレジェンド雀士であった老人たちからの指導に期待する蓮だったが、与えられた課題は麻雀の特訓とは到底思えないものばかりだった。老人たちにからかわれていると焦りを感じる蓮。そんな矢先、突然謎の黒服軍団が現われ、蓮は拉致されてしまう…。

今夏、東京で開催される麻雀の世界大会W R C。過去すべての大会で優勝してきたのが日本だ。ニンジャという絶対王者を擁する日本は今大会でも優勝が確実視されていた。一方、不慮の事故により怪我を負って野球を断念し、鬱々と最後の高校生活を送っていた坂本蓮はなんとなく始めたネット麻雀で不敗のニンジャの異名を取るほどだったが、どこか熱くなれずにいた。世界で戦うニンジャとネットで無敗のニンジャ。ふたりのニンジャが出会った時、何かが…！？