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南極での実験中に突如発生した謎の大地震。幾は父と共にその脅威に巻き込まれてしまう。家族の無事を祈る諒と母だが、大地震の後の世界は変容を遂げ、未曽有の洪水が発生し…。現代に警鐘を鳴らす黙示録が今開かれる――。

世界を水に沈めた海面上昇。その原因である実験は何故南極で行われたのか。気候難民の暮らす街で諒と幾はその謎に迫る。さらに、変動する気候は新たな大災害を生み出し…。現代に警鐘を鳴らす黙示録が今開かれる――。

極渦崩壊の影響による大寒波が猛威を振るい、その災禍は流氷となって根室の街を飲み込んだ。海上保安庁に知らせが届き、諒も出動するが、雪氷がひしめく救助は困難を極めており…。現代に警鐘を鳴らす黙示録が今開かれる――。

大寒波による流氷と荒天で陸の孤島と化した根室。流氷の上に置き去りとなった諒達は、極限状態からの生還を果たす。そして舞台は人類の希望の人工浮島、東京オメガフロートへ。しかし海の底から希望を奪う危機が…!?　現代に警鐘を鳴らす黙示録が今開かれる――。

絶海の孤島と化した東京オメガフロート。黒煙を吐き傾倒していく塔の中に取り残された、Dr.ワーグナーと幾の救出のために、涼は単身飛び込んでいく。崩壊していく塔から無事に二人を救い出せるのか!?　現代に警鐘を鳴らす黙示録が今開かれる――。

沈みゆく世界で住む場所を奪われた「舟人」。彼等は経済優先の社会が生み出した難民だ。人々の差別意識はいつしか暴走を生み、舟人の持ち船を東京湾へと放ってしまう。大量の漂流船と化した船の中に取り残される少女。出動命令で取材陣と共に現場へ向かう諒、やがてこの救出劇が日本中を巻き込む事件へ!?

エクリプスによる海面上昇を食い止める「南極再生プロジェクト」が始動!!　しかし計画のバックには世界経済の申し子・サクマタクトがおり、不穏な影を落とす。諒と幾は、すべての始まりの地・南極で何をみるのか？　サクマの思惑が絡む中、双子の運命の行方は!?