バツイチ子持ちの大狼十三は、子供の頃に組織に拾われた伝説の殺し屋。ある事件で謎の生物兵器に刺されて、中学生の姿になった十三は中学校へ…。中身はオジサン中学生の、学園アサシンやり直しコメディ、スタート！

中学生化した原因であるミツオカ製薬。そこのお嬢様・蜜岡ノレンの彼氏役になった十三。そんな彼は次々に婚約者の座を賭けて勝負を挑まれる。同業者のシンや、ハイスペックスポーツマン中学生の天馬に、十三は勝てるか!?

Wデート中に、まさかのオジサンに戻った十三!?　最悪のタイミングの中、ノレンが再び誘拐されてしまう。追跡する十三達だが、待ち構えていたのは、業界最大手所属の殺し屋が二人。十三＆天馬はノレン奪還できるか!?

殺し屋集う学校で、家庭科部内でチーム対抗ラーメン対決が!?　ラーメンにこだわりあるシンとノレンの勝負の結果は!?　そしてそこに訳ありの幻獣組（ユニコーン）の女性が…彼女の正体は!?

幻獣（ユニコーン）組の乙姫（ギャル姫）とのサーフィン対決の特訓中に、十三への気持ちが恋心では？と思い始めたノレン。恋愛に特訓に多忙な中、迎えた勝負の日。果たして十三達は勝てるか？

家庭科部の部員達が殺し屋に攫われてしまった！　危機的状況の中、獅童の前で銃を手に取る十三。皆を奪還するため獅童と共に殺し屋の後を追う。十三は無事に救出できるか!?

夏休みに、離島にあるノレンの別荘へ行く天馬や十三達。そこにはおばけが出ると噂されていて…!?　別荘に到着すると謎の仮面が現れて、そしてついに嵐の中で事件が……!?

家庭科部を挙げてのカップル強化作戦やキャンプで終えた夏休み。迎えた2学期、着任した新校長はかつて戦った桜花陽一郎!!　さらに新たな二人組が十三に決闘を申し込んできて…!?

騎兵と歩兵のタッグ戦のミツオカ決闘。百目鬼と八剣の容赦ない攻撃が襲う中、十三の戦略とは…？　そして学校では家庭科部の見せ場、文化祭に突入!!　売上対決が始まって!?

文化祭の売上対決での特別企画、ボーナス争奪戦に挑む家庭科部員。対するはアイドル幻獣組（ユニコーン）の有栖の三つ子達。勝負の行方は…!?　そして祭のあと、十三の前に少年が一人…。

桜花との死闘をノレンに目撃されてしまい、ついに正体を明かしてしまう十三。さらに事態に混乱するノレンに対して、爆弾発言を!?　そしてノレンの父の会社へ二人で乗り込み!?

占い部部長の占いで元殺し屋と見抜かれた十三。そして家庭科部では、ミツオカ騒動激化でノレンに生徒会より退部命令が。退部の取り消しを賭けてサバゲ―で挑む家庭科部。一方、十三は身バレ防止で本気で戦えず…!?

生徒会に勝利し、ノレンの退部を阻止した家庭科部。だが翌日、風邪を引いてしまった十三は、部員達から看病を受ける。そんな中、ノレンが突然、大人の姿になってしまい…!?