無敵の殺し屋兄さん、此度2度目のカムバック――！！　難敵ルーマーとの戦いが終結し、アザミ＆ユーカリが太平市を去って約2年――。生活は変わっても、根っこは変わらない“風変わり”な兄さん姉さんたち。“普通の日々”のその先で、無敵のアキラ兄さんの新たなる“秘密”が解き明かされていくのです――。

アキラとミサキとクロちゃんの、やがて愛しき“第３部”始動！！　キャンピングカーでのんびりとした日々を満喫していたアキラとミサキ。そんな２人に憧れて、ヤクザを辞めたクロちゃんも合流を果たし１年限りの共同生活が始まった。レンタルおっちゃんとして人々と交流するアキラや、タコちゃんを陥落せしめようと奮闘するヨウコ。一見、平和を極めたかのように見える太平市だったが、廃ホテルでの殺人事件を発端としてキナ臭いニオイが立ちのぼる！　“寓話”と呼ばれた殺し屋・ファブルを捜して、闇で蠢く謎の男たち。そんな中、クロちゃんのもとにはミサキと思しき女性が映った不可解な動画が届いてーー！！？

無敵の殺し屋兄さん“引退＆隠遁”伝説、第３部！！誰も知らない泉の底へーー、沈み込めた“秘密”があった‥‥。誰にも言えない闇の奥でーー、息を殺した“秘密”があったーー。ネットに流出しているミサキの同人AV動画の存在を知ってしまい、過去の自分に責任の一端があったかもしれないと心悩ますクロ。　動画の出自について調べていくうちに、先日、廃ホテルで殺された野村と山城、そしてミサキの隠された悲痛な過去へと辿り着く。クロは動画を流していると思われる井土という男の行方を捜すのだが‥‥！？　一方、元鮫剣組のバックにいた兄弟の殺し屋たちはファブル＝アキラの命を狙って元アリの面々と接触を図っていたーー。

無敵の殺し屋兄さん＆弾けろクロちゃん伝説“第３部”！！“カタギ”“として‥‥“クズ”として‥‥、卑劣なクソ野郎をぶっ潰せ。熱き弟子の“プロ”としてーーッ！！！ミサキが過去、苦しかった時代に盗撮されたと思われる同人AV動画。その流出元を追いかけるクロは、ついに犯人である井土の所在を突き止める！　その頃、ミサキ自身も知人からの電話で動画の存在を知らされ、深い苦悩の中にいたーー。かつてミサキをクソみたいな事務所に紹介してしまったという責任を感じるクロは、この事件にカタをつけるべく井土のマンションへ突入するーー！！