遠く山深い森の中、モノノケ達の世界との境目に櫻三村とよばれる村があった。妖狐族の金狐は、行方不明になった弟の銀狐を探しに櫻三村へでかけ、人間の少年・敦と出会う。なぜか敦だけには金狐の姿が見え、二人はすぐにうちとける。やがて金狐は敦の純真さに惹かれていき、よからぬ感情が芽生えてしまう…。合冊版1巻！！（君が妖は『フレイヤ連載』1～3話収録。）

「あーくんは友達なのに…」自分の中の欲望が抑えきれなくなっていく金狐。時を同じくして、妖怪たちが村人を襲うようになり、並々ならぬ力を持つ敦を標的としはじめる。そんな敦を護ろうと、金狐は掟をやぶり…！？合冊版、第2巻。（君が妖は『フレイヤ連載』4～6話収録。）

敦を妖怪たちから護ろうとする金狐。しかし、自ら敦を追いつめてしまうことに。「本当の友達だと思ってたのに…」敦に拒絶されショックを受ける金狐。それでも、敦に会いたい！妖怪と人間、種族を超えた友情の行方は…！？合冊版、第3巻。（君が妖は『フレイヤ連載』7～9話収録。）

敦と再び会えた金狐。喜びいっぱいの金狐に対し、敦は「俺とお前、どこかで会った？」敦は金狐のことを覚えていなかった…。その矢先、巨大な妖怪が現れ、敦が襲われ―！？懸命に呼び掛ける金狐に敦は…！？合冊版、第4巻。（君が妖は『フレイヤ連載』10～12話収録。）

1年前―。深手を負った銀狐の前に現れたのは…！？あの日いったい何があったのか。九尾様は何かを知っている―？そして夢から覚めた金狐の前に敦が…！？合冊版、第5巻。（君が妖は『フレイヤ連載』13～15話収録。）

「人間と相容れる事なんて、絶対無理なんだよ。」金狐にそう忠告する恭志郎。でも、あーくんが笑ってくれたから…。目覚めた敦に安堵する金弧は、ずっと胸につかえていたあの日の告白をする…。そして、明かされる恭志郎の過去、そして鴉族の悲劇―。合冊版、第6巻。（君が妖は『フレイヤ連載』16～18話収録。）

自制がきかなくなった恭志郎の脳裏によぎったのは―！？「僕、ハルキの事信じるよ。」金狐と敦、ふたりの再会。それは、あらたな物語りのはじまり―…。モノノ怪たちが魅せられる人間の欲と生。いま本能が疼きだす！！合冊版、第7巻。（君が妖は『フレイヤ連載』19～20話収録。）