神を信じない現実主義者の大学院生・冬哉は、「五頭竜山の伝説」現地調査のため踏み入った禁足の山で、美しい少年・スイと出会う。五頭竜山の護主に拾われ巫女の役目を与えられたスイは、他の人間と一切関わることなくひっそり生きてきたという。感情豊かで無垢なスイが、村の歪すぎる信仰に囚われず自由に生きられたら…と願う冬哉は、共に暮らす中でスイの運命と、自らの抱える大きな秘密を知ることになる。そして、山から降りたスイと冬哉は、ひょんなことから更科遊郭に古くからある伝説を調べることになった。「花絡新婦伝説亅。苦界に沈んだ女達の執着と情念が蜘蛛に化身したという言い伝えだ。しかもその遊郭には、冬哉の従兄弟である真夏がいた。スイと距離を取ろうとする冬哉、それを悲しむスイ、そして心の内を表さない真夏。三者三様の思惑の中で、事態は劇的な変化を遂げ……？――からんで、もつれて、手繰った糸のその先にあるのは――。